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    体系简介

    宏基因组测序mNGS(Metagenome Next Generation Sequencing)—— 是指对特定样品中的所有病原体 基因组举行高通量测序,该办法可以疾速、正确、高效地取得整个病原体群体的基因组信息。宏基因组测序不依 赖于病原体的分散培育,可以失掉样品中品貌较低乃至是痕量病原体的信息。比年来,宏基因组测序越来越多的 使用于医学和兽医研讨及临床诊断范畴。 VETKNOW植物病原宏基因组剖析体系是专门针对植物病原微生物宏基因组数据剖析的软件。VETKNOW有 自行研发的数据库,数据库收录了包括兽医罕见病原微生物在内的8000种病毒,30000种细菌(包括分枝杆 菌、支原体/衣原体和螺旋体),及猪牛羊鸡鸭鹅犬猫等宿主信息。剖析后果可表现病原、比对序列数 (reads),物种分类及农业乡村部一二三类植物疫病信息等

    装载测序剖析流程

    与现有其他病原疾速判定体系相比力,VETKNOW拥有以下特点

    内置物种数据库

    包罗10种以上的宿主物种,人、猪、山羊、绵羊、小鼠等;同时,支持定制化开辟更多宿主物种。

    收录凌驾2.7万种微生物,含新冠病毒序列,支持活期更新